《阿U的烦恼第二季》通过一场场亦真亦幻的童话冒险以及父母和老师的帮助，孩子们的烦恼都得到了圆满解决。

充满正义感的河狸毛球、胆小却爱吹牛的野兔大牙生活在广阔无垠的青青草原上。这天，毛球和大牙遇到了一只来自大都市的跳蚤，自称见多识广的跳蚤仙向着它们描绘了大都市的美好，还有人类所制作的各类美食甜点。他希望大牙和毛球能送它回到大都市。于是大牙和毛球踏上了前往人类大都市的旅程。